Микробная популяция играет важнейшую роль - эндогенный синтез витаминов, участие в метаболизме ряда биологически активных веществ

Главный представитель анаэробной кишечной микрофлоры - бифидобактерии - синтезируют аминокислоты, белки, витамины В₁, В₂, В₆, В₁₂, витамин К, никотиновую и фолиевую кислоты. Выдвинуто предположение, что некоторые вещества, вырабатываемые бифидобактериями, обладают антиоксидантными свойствами и способствуют снижению риска заболеваемости раком толстой кишки.

Среди аэробных микроорганизмов важнейшая роль в метаболических процессах принадлежит кишечной палочке, обладающей большим спектром функциональных свойств. E.coli вырабатывает несколько витаминов (тиамин, рибофлавин, пиридоксин, витамины В₁₂, К, никотиновую, фолиевую, пантотеновую кислоты), участвует в обмене холестерина, билирубина, холина, желчных и жирных кислот, и, опосредованно влияет на всасывание железа и кальция.

(Шульпекова. Ю.О. Избыточный бактериальный рост в кишечнике: патогенетические особенности и лечебные подходы. РМЖ, , 2003, Том 11, ? 5, с.281-285).